રાજેશ પર આક્ષેપો થયા બાદ પોલીસે 18 માર્ચે પૂજાનું પોસ્ટમોર્ટમ ત્રણ ડૉક્ટરોની પેનલ દ્વારા કરાવ્યું હતું. પોસ્ટમોર્ટમ બાદ તબીબોએ તેના વિસેરાને તપાસ માટે મોકલ્યા હતા. લગભગ એક મહિના પછી, 27 એપ્રિલ, 2019 ના રોજ, પૂજાનો પોસ્ટમોર્ટમ અને વિસેરા રિપોર્ટ આવ્યો, જેમાં તેણીના મૃત્યુનું કારણ માથામાં ઘાતક ઈજા અને ઝેરથી ભરેલું જ્યુસ પીવું હોવાનું જણાવાયું હતું.
આ પછી, 31 એપ્રિલે, પોલીસે આઈપીસીની કલમ 302 હેઠળ પૂજા રાયની હત્યાનો કેસ નોંધ્યો હતો. આ કેસની તપાસ પોલીસ સ્ટેશનના વડા રાજેશ મૌર્યને સોંપવામાં આવી હતી.
કેસની તપાસ સંભાળતાની સાથે જ પોલીસ સ્ટેશનના વડા રાજેશ મૌર્યએ તેમના ઉચ્ચ અધિકારીઓને પોસ્ટમોર્ટમ રિપોર્ટ અને કેસમાં થયેલા ફેરફારો વિશે માહિતી આપી. દક્ષિણ પશ્ચિમ દિલ્હીના ડીસીપી દેવેન્દ્ર આર્ય આ કેસમાં પહેલેથી જ રસ લઈ રહ્યા હતા.
આ કેસનો પર્દાફાશ કરવા માટે, તેણે ACP ઈશ્વર સિંહની દેખરેખ હેઠળ એક ટીમ બનાવી, જેમાં પોલીસ સ્ટેશનના વડા રાજેશ મૌર્ય, ઈન્સ્પેક્ટર સંજય શર્મા, ઈન્સ્પેક્ટર નરેન્દ્ર સિંહ ચહલ, SI મનીષ, પંકજ, ASI અજીત, કોન્સ્ટેબલ ગૌરવ વગેરે સામેલ હતા.
તે જ દિવસે, પોલીસ સ્ટેશન ઈન્ચાર્જે મૃતકના પતિ રાહુલ મિશ્રાને પોલીસ સ્ટેશન બોલાવ્યો અને કહ્યું કે પૂજાએ આત્મહત્યા કરી નથી, પરંતુ કોઈએ તેની હત્યા કરી છે. આથી તેમણે આ મામલાના ઉકેલમાં સહકાર આપવો જોઈએ.
પોલીસ સ્ટેશન ઈન્ચાર્જે જે કહ્યું તે સાંભળીને રાહુલને નવાઈ લાગી. તેણે કહ્યું, “સર, પૂજાને કોઈની સાથે દુશ્મની નહોતી. આવી સ્થિતિમાં તેને કોણ મારી શકે? જો એવું હોય તો મારી પત્નીના હત્યારાને શોધીને તેને વહેલી તકે પકડવાની કોશિશ કરો.
“ચિંતા કરશો નહીં, પોલીસ તેમનું કામ કરશે. બસ તપાસમાં સહકાર આપતા રહેજો.” પોલીસ સ્ટેશનના વડાએ રાહુલ પાસેથી તેને અને પૂજાને મળવા આવેલા તમામ લોકોના ફોન નંબર લેતા, તમામ નંબરોની કોલ ડિટેઈલ મેળવીને ઝીણવટથી તપાસતા કહ્યું. રાહુલની કોલ ડિટેઈલમાં એક ફોન નંબર મળ્યો હતો જેના પર તે ઘણી વાતો કરતો હતો.